MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 2844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018620	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018620	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018620	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018620	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018620	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018620	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018620	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018620	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018620	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018620	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018620	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018620	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018620	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018620	CAA	2	6	13984	13989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018620	TCT	2	6	14034	14039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018620	AAT	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018620	TTA	2	6	16930	16935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018620	AAT	2	6	17008	17013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018620	TAAA	2	8	17024	17031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018620	TTTC	2	8	17681	17688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018620	AG	3	6	17697	17702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018620	TCC	2	6	18548	18553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018620	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018620	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018620	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018620	T	6	6	20378	20383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018620	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018620	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018620	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018620	T	8	8	21770	21777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018620	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018620	T	6	6	21809	21814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018620	TTC	2	6	23766	23771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018620	T	7	7	23802	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018620	TGA	3	9	23843	23851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018620	AAG	2	6	23888	23893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018620	CTA	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018620	TTG	2	6	24013	24018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018620	CTG	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018620	TGTC	2	8	24055	24062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018620	AGT	2	6	24067	24072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018620	TTG	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018620	TCC	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018620	AGCT	2	8	24168	24175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018620	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018620	T	7	7	26576	26582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018620	TTC	2	6	26612	26617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018620	ATTT	2	8	26653	26660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018620	ATTA	2	8	26664	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018620	TTA	2	6	26695	26700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018620	A	6	6	30333	30338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018620	TTTC	2	8	31645	31652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018620	AGG	2	6	31739	31744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018620	T	6	6	31763	31768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018620	TC	3	6	31845	31850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018620	AGA	2	6	31962	31967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018620	CTT	2	6	31977	31982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018620	TCTA	2	8	32049	32056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018620	A	6	6	32358	32363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018620	AATT	2	8	32373	32380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018620	AAT	2	6	32402	32407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018620	TTAA	2	8	32413	32420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018620	TTA	2	6	33423	33428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018620	AAG	2	6	33444	33449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018620	A	6	6	33500	33505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018620	TTAA	2	8	33509	33516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018620	TGT	3	9	33523	33531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018620	AGAT	2	8	33552	33559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018620	AAG	2	6	33568	33573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018620	ATTTAA	2	12	33591	33602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018620	TGG	2	6	34225	34230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018620	ATAAA	2	10	34280	34289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018620	A	6	6	34297	34302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018620	TTC	2	6	37584	37589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018620	TTC	2	6	37625	37630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018620	TGC	2	6	37673	37678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018620	TC	3	6	37735	37740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018620	TCAA	2	8	37774	37781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018620	AGA	2	6	37863	37868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018620	TAT	2	6	38098	38103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018620	GAA	2	6	39474	39479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018620	TTA	2	6	42380	42385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018620	GAA	2	6	42402	42407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018620	AGT	2	6	42691	42696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018620	TTTTAA	2	12	42714	42725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018620	CAA	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018620	A	6	6	43431	43436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018620	GTT	2	6	43443	43448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018620	GAC	2	6	44135	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018620	ACG	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018620	GTCG	2	8	44193	44200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018620	GTC	2	6	44211	44216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018620	GAA	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018620	ATAA	2	8	49526	49533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018620	A	6	6	49535	49540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018620	TA	3	6	52209	52214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018620	GAT	2	6	52225	52230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018620	TCG	2	6	52292	52297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018620	TTG	2	6	52307	52312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018620	T	6	6	52323	52328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018620	T	8	8	52358	52365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018620	GTC	2	6	52411	52416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018620	A	6	6	52447	52452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018620	TTTTG	2	10	52482	52491	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018620	AAG	2	6	52511	52516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018620	AAAG	2	8	52606	52613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018620	TTTA	2	8	52616	52623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018620	A	6	6	54472	54477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018620	T	7	7	54497	54503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018620	AAT	2	6	54525	54530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018620	AAAG	2	8	54782	54789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018620	TCA	2	6	56015	56020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018620	AG	4	8	56041	56048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018620	GTT	2	6	57776	57781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018620	TGG	2	6	57856	57861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018620	TAA	2	6	57966	57971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018620	A	6	6	58058	58063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018620	A	8	8	58095	58102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018620	TCTTT	2	10	59372	59381	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018620	GGC	2	6	59411	59416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018620	GAG	2	6	59470	59475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018620	ATT	2	6	59519	59524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018620	TTA	2	6	59546	59551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018620	A	6	6	59568	59573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018620	TAA	2	6	59620	59625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018620	TG	3	6	59854	59859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018620	T	8	8	59860	59867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018620	CTA	2	6	59936	59941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018620	TG	3	6	63268	63273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018620	TTG	2	6	64340	64345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018620	A	6	6	64352	64357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018620	AGA	2	6	64367	64372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018620	AAT	2	6	64404	64409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018620	GCTTT	2	10	64510	64519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018620	CTTT	2	8	64530	64537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018620	AAT	2	6	64598	64603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018620	TGT	2	6	66114	66119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018620	ATT	2	6	66139	66144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018620	T	7	7	71034	71040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018620	A	7	7	71084	71090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018620	CACTT	2	10	71092	71101	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_018620	ATA	2	6	71200	71205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018620	T	6	6	72085	72090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018620	TTA	3	9	74052	74060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018620	ATC	2	6	76049	76054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018620	TCA	2	6	77374	77379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018620	TTC	2	6	77451	77456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018620	TAT	2	6	77483	77488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018620	TAAT	2	8	77623	77630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018620	TATT	2	8	77640	77647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018620	TTAA	2	8	77649	77656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018620	TAAA	2	8	77680	77687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018620	ATTA	2	8	77697	77704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_018620	TAT	2	6	77742	77747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018620	T	6	6	81770	81775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018620	AAT	2	6	83400	83405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_018620	T	6	6	87431	87436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_018620	TAA	2	6	130784	130789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_018620	ATT	2	6	131670	131675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_018620	TAT	2	6	133269	133274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_018620	ACC	2	6	138975	138980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_018620	TGA	2	6	139068	139073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_018620	A	7	7	139505	139511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018620	TAGT	2	8	140219	140226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_018620	TAT	2	6	144956	144961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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